MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_2

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010656	CT	3	6	56	61	0 %	50 %	0 %	50 %	187729966
2	NC_010656	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	187729966
3	NC_010656	ATG	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729966
4	NC_010656	GAC	2	6	231	236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010656	ACC	2	6	237	242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010656	A	6	6	247	252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010656	GTTTT	2	10	306	315	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010656	GT	3	6	338	343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010656	G	6	6	383	388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010656	T	6	6	404	409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010656	CG	3	6	420	425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010656	TGA	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010656	AGA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729965
14	NC_010656	TGC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729965
15	NC_010656	CCT	2	6	836	841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187729965
16	NC_010656	TGGT	2	8	861	868	0 %	50 %	50 %	0 %	187729965
17	NC_010656	CAT	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187729965
18	NC_010656	GAA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729965
19	NC_010656	TTG	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729965
20	NC_010656	GTT	2	6	1032	1037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187729965
21	NC_010656	AATG	2	8	1095	1102	50 %	25 %	25 %	0 %	187729965
22	NC_010656	CTG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187729965
23	NC_010656	CTT	2	6	1232	1237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187729965
24	NC_010656	GAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729965
25	NC_010656	TTGC	2	8	1293	1300	0 %	50 %	25 %	25 %	187729965
26	NC_010656	A	6	6	1512	1517	100 %	0 %	0 %	0 %	187729965
27	NC_010656	TCC	2	6	1520	1525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187729965
28	NC_010656	CGA	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187729965
29	NC_010656	TGA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187729965
30	NC_010656	AATATT	2	12	1675	1686	50 %	50 %	0 %	0 %	187729964
31	NC_010656	T	8	8	1720	1727	0 %	100 %	0 %	0 %	187729964
32	NC_010656	AAG	2	6	1728	1733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187729964
33	NC_010656	AATT	2	8	1835	1842	50 %	50 %	0 %	0 %	187729964
34	NC_010656	TA	3	6	1844	1849	50 %	50 %	0 %	0 %	187729964
35	NC_010656	AAAC	2	8	1856	1863	75 %	0 %	0 %	25 %	187729964
36	NC_010656	TGCA	2	8	1984	1991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.